Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FgbQ8K0E8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FgbQ8K0E8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FgbQ8K0E8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FgbQ8K0E8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FgbQ8K0E8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FgbQ8K0E8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms