Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rftn2Q8CHX7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rftn2Q8CHX7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rftn2Q8CHX7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rftn2Q8CHX7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rftn2Q8CHX7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms