Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGD2

Crispld1, Cysteine-rich secretory protein LCCL domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crispld1Q8CGD2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crispld1Q8CGD2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crispld1Q8CGD2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Crispld1Q8CGD2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Crispld1Q8CGD2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crispld1Q8CGD2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms