Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hpf1Q8CFE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hpf1Q8CFE2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Hpf1Q8CFE2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hpf1Q8CFE2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms