Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl11Q8CE33 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klhl11Q8CE33 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl11Q8CE33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl11Q8CE33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms