Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc17Q8CE13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc17Q8CE13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc17Q8CE13 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc17Q8CE13 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc17Q8CE13 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc17Q8CE13 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms