Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bcas3Q8CCN5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Bcas3Q8CCN5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bcas3Q8CCN5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bcas3Q8CCN5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bcas3Q8CCN5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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