Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Podxl2Q8CAE9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Podxl2Q8CAE9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Podxl2Q8CAE9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podxl2Q8CAE9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podxl2Q8CAE9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Podxl2Q8CAE9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Podxl2Q8CAE9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Podxl2Q8CAE9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Podxl2Q8CAE9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms