Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9X1

Sntn, Sentan, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SntnQ8C9X1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SntnQ8C9X1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SntnQ8C9X1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SntnQ8C9X1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SntnQ8C9X1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms