Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc186Q8C9S4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc186Q8C9S4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc186Q8C9S4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc186Q8C9S4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc186Q8C9S4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms