Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc15Q8C9M2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc15Q8C9M2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc15Q8C9M2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc15Q8C9M2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc15Q8C9M2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms