Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tsr2Q8C8T8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tsr2Q8C8T8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tsr2Q8C8T8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tsr2Q8C8T8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsr2Q8C8T8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms