Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8C5C9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8C5C9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q8C5C9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q8C5C9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q8C5C9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8C5C9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q8C5C9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C5C9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q8C5C9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8C5C9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8C5C9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8C5C9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms