Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3M9

Uncharacterized protein C2orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3M9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3M9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3M9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q8C3M9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q8C3M9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3M9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3M9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q8C3M9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C3M9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C3M9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q8C3M9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C3M9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C3M9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q8C3M9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C3M9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C3M9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C3M9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C3M9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q8C3M9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms