Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0T1

Fem1ab, Protein fem-1 homolog A-B, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fem1abQ8C0T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fem1abQ8C0T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fem1abQ8C0T1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fem1abQ8C0T1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fem1abQ8C0T1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms