Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ythdf3Q8BYK6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ythdf3Q8BYK6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdf3Q8BYK6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms