Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sec22cQ8BXT9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sec22cQ8BXT9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sec22cQ8BXT9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec22cQ8BXT9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec22cQ8BXT9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms