Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsfm13Q8BXS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfsfm13Q8BXS2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsfm13Q8BXS2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms