Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Skor1Q8BX46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Skor1Q8BX46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Skor1Q8BX46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Skor1Q8BX46 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Skor1Q8BX46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Skor1Q8BX46 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms