Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dclk3Q8BWQ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclk3Q8BWQ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dclk3Q8BWQ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dclk3Q8BWQ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk3Q8BWQ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms