Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp38Q8BW70 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp38Q8BW70 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp38Q8BW70 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp38Q8BW70 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp38Q8BW70 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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