Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc122Q8BVN0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc122Q8BVN0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc122Q8BVN0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc122Q8BVN0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc122Q8BVN0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms