Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Als2cr12Q8BVM7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Als2cr12Q8BVM7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Als2cr12Q8BVM7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Als2cr12Q8BVM7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Als2cr12Q8BVM7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Als2cr12Q8BVM7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms