Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx17Q8BVL3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Snx17Q8BVL3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx17Q8BVL3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx17Q8BVL3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx17Q8BVL3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx17Q8BVL3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
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