Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad3Q8BUN5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad3Q8BUN5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smad3Q8BUN5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smad3Q8BUN5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad3Q8BUN5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms