Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep55Q8BT07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cep55Q8BT07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cep55Q8BT07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cep55Q8BT07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms