Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pbrm1Q8BSQ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Pbrm1Q8BSQ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Pbrm1Q8BSQ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Pbrm1Q8BSQ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms