Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gga3Q8BMI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gga3Q8BMI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gga3Q8BMI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gga3Q8BMI3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms