Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Me3Q8BMF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Me3Q8BMF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Me3Q8BMF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Me3Q8BMF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Me3Q8BMF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Me3Q8BMF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms