Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabra5Q8BHJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra5Q8BHJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gabra5Q8BHJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabra5Q8BHJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabra5Q8BHJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabra5Q8BHJ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms