Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH88

Depdc1b, DEP domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc1bQ8BH88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Depdc1bQ8BH88 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Depdc1bQ8BH88 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Depdc1bQ8BH88 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Depdc1bQ8BH88 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms