Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AW551984Q8BGF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AW551984Q8BGF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AW551984Q8BGF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AW551984Q8BGF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AW551984Q8BGF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AW551984Q8BGF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AW551984Q8BGF0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AW551984Q8BGF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AW551984Q8BGF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AW551984Q8BGF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AW551984Q8BGF0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms