Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc4Q8BG19 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmtc4Q8BG19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmtc4Q8BG19 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmtc4Q8BG19 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc4Q8BG19 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms