Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnpo1Q8BFY9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnpo1Q8BFY9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tnpo1Q8BFY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tnpo1Q8BFY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tnpo1Q8BFY9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms