Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms