Protein–RNA interactions for Protein: Q812A5

Prr5, Proline-rich protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr5Q812A5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prr5Q812A5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr5Q812A5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr5Q812A5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prr5Q812A5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr5Q812A5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms