Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q80Y73 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q80Y73 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q80Y73 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q80Y73 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q80Y73 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q80Y73 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80Y73 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80Y73 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80Y73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80Y73 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80Y73 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80Y73 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80Y73 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q80Y73 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q80Y73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q80Y73 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q80Y73 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q80Y73 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q80Y73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q80Y73 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q80Y73 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q80Y73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q80Y73 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q80Y73 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q80Y73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q80Y73 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q80Y73 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q80Y73 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q80Y73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q80Y73 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q80Y73 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q80Y73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q80Y73 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q80Y73 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q80Y73 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q80Y73 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q80Y73 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q80Y73 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q80Y73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q80Y73 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q80Y73 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q80Y73 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q80Y73 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q80Y73 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q80Y73 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q80Y73 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q80Y73 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q80Y73 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q80Y73 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q80Y73 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q80Y73 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q80Y73 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q80Y73 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q80Y73 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q80Y73 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80Y73 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80Y73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80Y73 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80Y73 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80Y73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80Y73 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80Y73 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80Y73 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80Y73 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80Y73 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80Y73 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q80Y73 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q80Y73 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Q80Y73 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q80Y73 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q80Y73 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q80Y73 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q80Y73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q80Y73 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q80Y73 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q80Y73 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q80Y73 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q80Y73 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q80Y73 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q80Y73 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q80Y73 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q80Y73 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q80Y73 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q80Y73 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q80Y73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q80Y73 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q80Y73 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q80Y73 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q80Y73 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q80Y73 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q80Y73 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q80Y73 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80Y73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80Y73 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80Y73 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80Y73 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80Y73 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80Y73 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q80Y73 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms