Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh8Q80Y20 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh8Q80Y20 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh8Q80Y20 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alkbh8Q80Y20 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Alkbh8Q80Y20 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh8Q80Y20 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms