Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcsk9Q80W65 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcsk9Q80W65 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcsk9Q80W65 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcsk9Q80W65 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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