Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr2eQ80UW8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2eQ80UW8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2eQ80UW8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr2eQ80UW8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr2eQ80UW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms