Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab3gap1Q80UJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rab3gap1Q80UJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab3gap1Q80UJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms