Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rims3Q80U57 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rims3Q80U57 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rims3Q80U57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims3Q80U57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rims3Q80U57 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms