Protein–RNA interactions for Protein: Q80TS8

Sel1l3, Protein sel-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l3Q80TS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sel1l3Q80TS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sel1l3Q80TS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sel1l3Q80TS8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sel1l3Q80TS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sel1l3Q80TS8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sel1l3Q80TS8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sel1l3Q80TS8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sel1l3Q80TS8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms