Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.5■■■■■ 5.52
NischQ80TM9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.5■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.47■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC49.47■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.46■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC49.46■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
NischQ80TM9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
NischQ80TM9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
NischQ80TM9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
NischQ80TM9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
NischQ80TM9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.4■■■■■ 5.5
NischQ80TM9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
NischQ80TM9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.5
NischQ80TM9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC49.36■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.36■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC49.35■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC49.33■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
NischQ80TM9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC49.31■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC49.28■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC49.28■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
NischQ80TM9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
NischQ80TM9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.24■■■■■ 5.47
NischQ80TM9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
NischQ80TM9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
NischQ80TM9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC49.19■■■■■ 5.47
NischQ80TM9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.19■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC49.19■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.19■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC49.17■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC49.15■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC49.13■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC49.13■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC49.13■■■■■ 5.46
NischQ80TM9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC49.11■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC49.11■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.08■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
NischQ80TM9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC49.05■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.03■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.03■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC49.03■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC49.01■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
NischQ80TM9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC48.96■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.95■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC48.95■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC48.95■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
NischQ80TM9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
NischQ80TM9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC48.9■■■■■ 5.42
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