Protein–RNA interactions for Protein: Q80TC6

Zswim5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim5Q80TC6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim5Q80TC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim5Q80TC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim5Q80TC6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim5Q80TC6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim5Q80TC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zswim5Q80TC6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zswim5Q80TC6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zswim5Q80TC6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim5Q80TC6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim5Q80TC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms