Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdc42bpbQ7TT50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdc42bpbQ7TT50 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdc42bpbQ7TT50 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdc42bpbQ7TT50 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Cdc42bpbQ7TT50 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms