Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rexo1Q7TT28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rexo1Q7TT28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rexo1Q7TT28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rexo1Q7TT28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo1Q7TT28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo1Q7TT28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo1Q7TT28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo1Q7TT28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo1Q7TT28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rexo1Q7TT28 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms