Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgo2Q7TSY8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sgo2Q7TSY8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sgo2Q7TSY8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sgo2Q7TSY8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms