Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPV4

Mybbp1a, Myb-binding protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybbp1aQ7TPV4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mybbp1aQ7TPV4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mybbp1aQ7TPV4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mybbp1aQ7TPV4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mybbp1aQ7TPV4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mybbp1aQ7TPV4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms