Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1cQ76I25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1cQ76I25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Higd1cQ76I25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Higd1cQ76I25 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms